潔凈室空調是空調工程中的一種，它不僅對室內空氣的溫度、濕度、風速有一定要求，而且對空氣中的含塵粒數(shù)、細菌濃度等均有較高的要求。因此它不僅對通風工程的設計施工有特殊要求，對建筑布局、材料選用、施工工序、建筑做法、水暖電通及工藝本身的設計、施工均有特殊的要求與相應的技術措施，其造價也相應提高。
潔凈空調與一般空調的區(qū)別：
（1）主要參數(shù)控制：一般空調側重溫度、濕度、新鮮空氣量的供給，而潔凈室空調則側重控制室內空氣的含塵量、風速、換氣次數(shù)。在溫濕度有要求的房間，它們也是主要控制參數(shù)。生物潔凈室對細菌含量也是主要的控制參數(shù)之一。
（2）空氣過濾手段：一般空調有的只有粗效一級過濾，要求較高的是粗效中效二級過濾處理。而潔凈空調則要求三級過濾，即粗、中、三級過濾，或粗、中、亞三級過濾，生物潔凈室除送風系統(tǒng)有三級過濾外，在排風系統(tǒng)為了消除動物的特殊臭味及避免對環(huán)境的污染依據(jù)不同情況尚設二級過濾或濾毒吸附過濾。
（3）室內壓力要求：一般空調對室內壓力無特殊要求，而潔凈空調為了避免外界污染空氣的滲入或不同生產(chǎn)車間不同物質的相互影響，對不同潔凈區(qū)的正壓值均有不同的要求。在負壓潔凈室內尚有負壓度的控制要求。
（4）潔凈空調系統(tǒng)材料和設備的選擇、加工工藝、加工安裝環(huán)境、設備部件貯存環(huán)境，為了避免被外界污染，均有特殊的要求。這也是一般空調系統(tǒng)所沒有的。
（5）對氣密性的要求：一般空調系統(tǒng)，對系統(tǒng)的氣密性，滲氣量雖有要求。但潔凈空調系統(tǒng)的要求要比一般空調系統(tǒng)高得多，其檢測手段，各工序的標準均有嚴格措施及檢測要求。
（6）對土建及其它工種的要求。一般空調房間，對建筑布局、熱工等有要求，但對選材及氣密性要求不是很注重。而潔凈空調對建筑質量的評價除一般建筑的外觀等要求外，則側重于防塵、防起塵、防滲漏。在施工工序安排及搭接上要求很嚴格，以避免返工，產(chǎn)生裂縫造成滲漏。它對其它工種的配合、要求也很嚴格，主要均集中在防止?jié)B漏，避免外部污染空氣滲入潔凈室及防止積塵對潔凈室的污染。